El apellido Congote es un apellido de origen español. Se cree que proviene de la palabra con que significa con y gote que significa goteo. Esto sugiere que el apellido se originó como una forma de describir a alguien que goteaba. Los descendientes de Congote se encuentran principalmente en Colombia, donde el apellido es muy común. También se encuentran en otros países de América Latina, como México, Perú, Ecuador y Venezuela. Los Congote también se han establecido en Estados Unidos, donde se han convertido en una familia de éxito.
El primer Congote en llegar a Colombia fue Francisco Congote, quien nació en España en 1550. Tuvo dos hijos. Su profesión era la de comerciante.