El apellido Huarte es un apellido de origen vasco, que significa altura. Se cree que los primeros portadores de este apellido llegaron a Colombia en el siglo XVI. Los descendientes de los Huarte se han extendido por todo el país, especialmente en la región andina. El apellido Huarte se ha asociado con la nobleza, el comercio y la agricultura. Los Huarte también han destacado en el campo de la educación, la medicina, la política y la religión.
El primer Huarte en llegar a Colombia fue Francisco Huarte, quien nació en España en 1550. Tuvo dos hijos. Su profesión era la de comerciante.