El apellido Núñez es un apellido de origen español que significa hijo de Núñez. Se cree que el origen de este apellido se remonta a una familia noble de la región de Castilla, España. El apellido Núñez se ha extendido por todo el mundo, especialmente a América Latina. En Colombia, el apellido Núñez es uno de los apellidos más comunes. Se cree que los primeros portadores del apellido Núñez en Colombia llegaron en el siglo XVI. Desde entonces, el apellido Núñez se ha extendido por todo el país. Los descendientes de los portadores del apellido Núñez en Colombia han contribuido a la cultura, la economía y la política del país.
La primera persona con el apellido Núñez en llegar a Colombia fue Francisco Núñez de León, un conquistador español. Tuvo dos hijos, Francisco Núñez de León y Diego Núñez de León. Su profesión era la de conquistador.