El apellido Villafana es un apellido de origen español. Se cree que proviene de la palabra villa, que significa pueblo o aldea. Los descendientes de este apellido se encuentran principalmente en Colombia, Venezuela, Ecuador, Perú, Argentina, Chile y España. El apellido Villafana se asocia con la nobleza y la riqueza, ya que los primeros portadores de este apellido eran ricos terratenientes. Los Villafana son conocidos por su lealtad, su trabajo duro y su amor por la familia.
La primera persona con el apellido Villafana en llegar a Colombia fue Francisco Villafana, quien era un comerciante. No se conoce la cantidad de hijos que tuvo.