El apellido Villalon es un apellido de origen español. Se cree que proviene de una localidad llamada Villalón, ubicada en la provincia de Burgos, España. El significado del apellido es de la aldea de Villalón. Los descendientes de este apellido se encuentran principalmente en Colombia, Venezuela, México, Estados Unidos y España.
El primer Villalón en llegar a Colombia fue Francisco Villalón, quien nació en España en el siglo XVI. Tuvo dos hijos. Su profesión era la de comerciante.