El apellido Zarate es un apellido de origen español. Se cree que proviene de la región de Zaragoza, España. El significado del apellido es de la ciudad de Zaragoza. Los descendientes de Zarate se encuentran en toda América Latina, especialmente en Colombia, México, Argentina, Chile y Perú. El apellido Zarate es uno de los apellidos más comunes en Colombia.
El primer Zarate en llegar a Colombia fue Francisco Zarate, quien nació en España en 1550. Tenía dos hijos. Su profesión era la de comerciante.