El apellido Aguer es un apellido de origen francés que se asocia con la región de Aquitania. Esta región se encuentra en el suroeste de Francia, cerca de la frontera con España. El apellido Aguer se asocia con la nobleza y la aristocracia, y se cree que los primeros portadores del apellido eran caballeros y señores feudales. El apellido también se asocia con la religión católica, ya que muchos de los primeros portadores del apellido eran monjes y clérigos. El apellido Aguer se ha extendido por toda Europa, y también se ha encontrado en América Latina, especialmente en Colombia. Los portadores del apellido Aguer en Colombia se cree que son descendientes de los primeros inmigrantes franceses que llegaron al país en el siglo XIX. El primer individuo con el apellido Aguer en Colombia fue Francisco Aguer, un médico y catedrático de la Universidad de Córdoba, quien nació en el año 1845. Fue uno de los primeros médicos en Colombia en estudiar la enfermedad de la tuberculosis. También fue uno de los primeros en estudiar la enfermedad de la malaria en el país. Además, fue uno de los primeros en estudiar la enfermedad de la lepra en Colombia.