El apellido Zipaquira es un apellido de origen español que se deriva de la localidad de Zipaquirá, ubicada en el departamento de Cundinamarca, Colombia. El significado de este apellido es lugar de sal. Los descendientes de este apellido se encuentran principalmente en Colombia, pero también hay algunos en otros países de América Latina. Los Zipaquira son conocidos por su trabajo duro, su lealtad y su amor por la familia. Esta familia ha contribuido a la cultura colombiana a través de la música, la literatura, el arte y la gastronomía.
La primera persona con el apellido Zipaquira en llegar a Colombia fue Francisco Zipaquira, quien era un comerciante. No se conoce la cantidad de hijos que tuvo.